Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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