Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms