Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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