Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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