Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTRF1LQ9UGC7 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms