Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms