Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms