Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms