Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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