Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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