Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms