Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms