Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms