Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms