Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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