Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms