Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms