Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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LRRC71Q8N4P6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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