Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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