Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOP1Q7RTM1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms