Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP45Q70EL2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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USP45Q70EL2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP45Q70EL2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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