Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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