Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMBQ6PCB8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMBQ6PCB8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms