Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM208BQ5VWN6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms