Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCAF6Q58WW2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms