Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms