Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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