Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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