Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK5Q16478 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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