Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNGA3Q16281 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms