Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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