Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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