Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARHGEF6Q15052 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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