Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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