Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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