Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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