Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms