Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PTCH1Q13635 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PTCH1Q13635 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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