Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH18Q13634 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms