Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms