Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
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