Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms