Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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