Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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