Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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