Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXC1Q12948 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXC1Q12948 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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