Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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