Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLCB2Q00722 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms