Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA1P78396 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms