Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2FP61218 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms